W 1998 r. biskup zielonogórsko-gorzowski, Adam Dyczkowski, zaprosił franciszkanów z Prowincji św. Antoniego i bł. Jakuba Strzemię do założenia domu zakonnego w swojej diecezji, w Zielonej Górze. W swoim liście napisał: „Mam nadzieję, że duchowi synowie św. Franciszka z Asyżu wniosą w życie miasta i diecezji nie tylko bogatą tradycję franciszkańską, ale także świadectwo mocy zwycięskiej wiary, ujawnione w postawie i męczeństwie św. Maksymiliana Marii Kolbe” (List z dnia 14.07.1998 r.).

Franciszkanie przyjęli zaproszenie i po rozmowach, 20 maja 1999 r. została podpisana umowa między kurią diecezjalną w Zielonej Górze i krakowskimi franciszkanami, na mocy której został przekazany zakonnikom teren na budowę kościoła i centrum duszpasterskiego.